2023年，使用吉凯基因的产品/服务发表的文献1100+篇。历年累计20000+篇！
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往期回顾
1//异常m5C超甲基化通过NSUN2/YBX1/QSOX1轴介导EGFR-非小细胞肺癌癌症对吉非替尼的内在耐药
Aberrant m5C hypermethylation mediates intrinsic resistance to gefitinib through NSUN2/YBX1/QSOX1 axis in EGFR-mutant non-small-cell lung cancer
发表期刊：Molecular Cancer
IF: 41.444
发表单位：郑州大学第一附属医院
吉凯助力：QSOX1 干扰慢病毒质粒
文章摘要：核糖核酸5-甲基胞嘧啶（m5C）修饰在各种肿瘤的发病机制中起着关键作用。然而，RNA-m5C修饰在肿瘤耐药性中的作用和分子机制尚不清楚。在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系和患者样本中测定RNA m5C甲基化、m5c writer NOP2/Sun RNA甲基转移酶家族成员2（NSUN2）和EGFR-TKIs耐药性之间的相关性。NSUN2对EGFR-TKIs耐药性的影响通过体外和体内功能获得和丧失试验进行了研究。通过RNA测序（RNA-seq）、亚硫酸氢钠RNA测序（RNA BisSeq）和m5C甲基化RNA免疫沉淀qPCR（MeRIP-qPCR）鉴定参与EGFR-TKIs耐药性的NSUN2靶基因。此外，通过功能拯救和嘌呤霉素掺入试验研究了NSUN2调节靶基因表达的调节机制。RNA-m5C高甲基化和NSUN2与EGFR-TKIs的内在耐药性显著相关。NSUN2的过表达导致吉非替尼耐药性和肿瘤复发，而NSUN2基因抑制导致肿瘤消退，并在体外和体内克服了对吉非替尼本征耐药性。整合RNA-seq和m5C-BisSeq分析确定静止蛋白巯基氧化酶1（QSOX1）是异常m5C修饰的潜在靶点。NSUN2甲基化了QSOX1编码序列区，导致QSOX1通过m5C阅读器Y盒结合蛋白1（YBX1）的增强翻译。研究揭示了通过NSUN2-YBX1-QSOX1轴的异常RNA m5C修饰在EGFR突变体NSCLC中介导对吉非替尼的内在耐药性中的关键功能。
2//瑞格菲尼通过ERK/MDM2/p53轴抑制EphA2磷酸化并导致肝损伤
Regorafenib inhibits EphA2 phosphorylation and leads to liver damage via the ERK/MDM2/p53 axis
发表期刊：Nature Communications
IF: 17.694
发表单位：浙江大学药学院药物安全评价研究中心
吉凯助力：EphA2 过表达腺相关病毒
文章摘要：瑞格菲尼的肝毒性是患者最值得注意的问题之一，但其机制尚不清楚。因此，目前还缺乏有效的干预策略。在这里，通过比较与索拉非尼的比较，作者发现瑞格非尼诱导的肝损伤主要是由于其非治疗性靶点Eph受体A2（EphA2）。瑞格菲尼治疗雄性小鼠的肝损伤和细胞凋亡。在机制上，瑞格菲尼通过影响细胞外信号调节激酶（ERK）/MDM2轴，改变鼠双微体（MDM2）的胞内定位，从而抑制EphA2 Ser897磷酸化，减少p53的泛素化。同时，作者发现五味子丙素C可以上调EphA2Ser897位点的磷酸化，在体内对毒性也有保护作用。总的来说，抑制EphA2 Ser897磷酸化是瑞格菲尼诱导肝毒性的关键原因，而化学激活EphA2 Ser897是一种潜在的治疗策略来防止瑞格菲尼诱导的肝毒性。
3//HDAC9介导的G2/M上皮细胞周期阻滞导致雄性小鼠肾纤维化
HDAC9-mediated epithelial cell cycle arrest in G2/M contributes to kidney fibrosis in male mice
发表期刊：Nature Communications
IF: 17.694
发表单位：山东大学基础医学院
吉凯助力：HDAC9 过表达慢病毒 STAT1 过表达腺病毒
文章摘要：肾小管上皮细胞（TECs）通过介导G2/M的周期阻滞，在肾纤维化中发挥关键作用。然而，参与TECsG2/M阻滞的关键HDAC亚型及其潜在机制尚不清楚。在这里，作者发现Hdac9在小鼠纤维化肾脏中显著诱导表达，特别是在马兜铃酸肾病（AAN）或单侧输尿管梗阻（UUO）诱导的近端小管中。HDAC9的肾小管特异性缺失或TMP195的药理抑制减弱G2/M上皮细胞周期阻滞，然后减少促纤维化细胞因子的产生，减轻肾小管间质纤维化。在体外，抑制或抑制HDAC9可以减轻TECs中上皮细胞表型的丢失，并通过抑制G2/M中的上皮细胞周期阻滞来减弱成纤维细胞的活化。在机制上，HDAC9去乙酰化STAT1并促进其重新激活，随后诱导TECs的G2/M阻滞，最终导致肾小管间质纤维化。综上所述，作者的研究表明HDAC9可能是肾纤维化的一个有吸引力的治疗靶点。
4//PERK介导的来自IDH突变体胶质瘤的胆固醇排泄决定了小胶质细胞的抗肿瘤极化
PERK-Mediated Cholesterol Excretion from IDH Mutant Glioma Determines Anti-Tumoral Polarization of Microglia
发表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
发表单位：中山大学第七附属医院
吉凯助力：IDH1 过表达慢病毒
文章摘要：异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变是一种已知的病理分类，它在胶质瘤细胞中启动代谢重编程，并与胶质瘤相关的小胶质细胞/巨噬细胞（GAMs）的反应状态有关。然而，目前尚不清楚IDH基因型如何促进GAM表型。此研究表明，表达突变体IDH的胶质瘤决定了GAMs的m1样极化，而典型的IDH则诱导了m2样极化。有趣的是，IDH-突变的神经胶质瘤分泌过量的胆固醇，在不改变其胆固醇生物合成的情况下，导致富含胆固醇的促炎gam，同时由于胆固醇转运分子的表达重构，特别是ABCA1的上调和LDLR的下调，而表现出低水平的肿瘤胆固醇。在机制上，一个miR-19a/LDLR轴介导的新型转录后胆固醇摄取调控被识别出来，由IDH突变调节，并影响肿瘤细胞的增殖和侵袭。IDH突变诱导的PERK激活通过miR-19a/LDLR轴和ABCA1/APOE的上调，增强了来自胶质瘤细胞的胆固醇输出。此外，引入了合成的PERK激活剂CCT020312，它显著刺激IDH野生型胶质瘤细胞的胆固醇外排，诱导GAMs的m1样极化，从而抑制胶质瘤细胞的侵袭。研究发现揭示了PERK/miR-19a/LDLR信号通路在协调胶质体胆固醇转运和随后的GAMs表型中的重要作用，从而突出了胶质瘤治疗的一个新的潜在靶点通路。
5//YBX1介导的DNA甲基化依赖的SHANK3在精神分裂症患者PBMC和发育中的皮质中间神经元中的表达
YBX1-Mediated DNA Methylation-Dependent SHANK3 Expression in PBMCs and Developing Cortical Interneurons in Schizophrenia
发表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
发表单位：四川大学华西医院
吉凯助力：YBX1 干扰慢病毒
文章摘要：精神分裂症（SCZ）是一种严重的精神和神经发育障碍。SCZ的病理过程在发育早期就开始了，在精神病症状首次出现之前。DNA甲基化在调节基因表达中起着重要作用，而DNA甲基化失调参与了多种疾病的发病机制。甲基化DNA免疫沉淀芯片（MeDIP-chip）用于研究首发SCZ（FES）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的全基因组DNA甲基化失调。结果显示，SHANK3启动子发生高甲基化，这种高甲基化（HyperM）与左侧颞下皮层的皮质表面积呈负相关，与FES的阴性症状亚得分呈正相关。研究进一步发现，转录因子YBX1在诱导多能干细胞（iPSCs）来源的皮质中间神经元（cINs）中与SHANK3启动子的HyperM区域结合，但与谷氨酸能神经元无关。此外，利用shrna在cINs中证实了YBX1对SHANK3表达的直接和正向调控作用。综上所述，cINs中SHANK3表达的失调表明，DNA甲基化可能在SCZ的神经病理机制中发挥作用。研究结果还表明，PBMCs中SHANK3的HyperM可以作为SCZ的潜在外周生物标志物。
6//吸烟诱导的M2 TAMs通过EVs中的circEML4，通过ALKBH5调节的NSCLC细胞中SOCS2的m6A修饰促进NSCLC的进展
Smoking-Induced M2-TAMs, via circEML4 in EVs, Promote the Progression of NSCLC through ALKBH5-Regulated m6A Modification of SOCS2 in NSCLC Cells
发表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
发表单位：南京医科大学
吉凯助力：SOCS2 荧光素酶报告质粒
文章摘要：肺癌是世界范围内常见的诊断疾病，非小细胞肺癌（NSCLCs）约占病例的85%。香烟烟雾是一种促进NSCLC进展的暴露环境，但其作用尚不清楚。此研究报道了吸烟诱导的NSCLC组织周围m2型肿瘤相关巨噬细胞（M2-TAMs）的积累促进了恶性肿瘤。具体来说，来自香烟烟雾提取物（CSE）诱导的M2巨噬细胞的细胞外囊泡（EVs）在体内和体外都促进了NSCLC细胞的恶性肿瘤。CSE诱导的M2巨噬细胞ev中的circEML4被转运到NSCLC细胞，在那里它通过与人类AlkB同源物H5（ALKBH5）相互作用，减少了ALKBH5在细胞核中的分布，导致N6-甲基腺苷（m6A）修饰的升高。m6A-seq和RNA-seq通过ALKBH5调控SOCS2，介导的SOCS2和转录激活因子（JAK-STAT）通路的激活。CSE诱导的M2巨噬细胞中EV中circEML4的下调逆转了EV增强的NSCLC细胞的致瘤性和转移性。此外，此研究还发现，吸烟患者的circeml4阳性的M2-TAMs水平有所增加。这些结果表明，吸烟诱导的通过circEML4诱导的M2-TAMs通过alkbh5调控的m6A修饰SOCS2促进NSCLC的进展。此研究还表明，TAMsev中的circEML4可作为NSCLC的诊断生物标志物，特别是对于有吸烟史的患者。
7//PD-L1的甲基化限制了PD-L1/PD-1的相互作用以控制癌症免疫监测
PD-L1 methylation restricts PD-L1/PD-1 interactions to control cancer immune surveillance
发表期刊：Science Advances
IF: 14.957
发表单位：华中科技大学同济医学院
吉凯助力：Luciferase 过表达慢病毒
文章摘要：针对程序性细胞死亡蛋白1（PD-1）或程序性细胞死亡1配体1（PD-L1）的免疫检查点抑制剂已使一些癌症患者获得持久、完整的治疗反应；然而，缺乏可靠的抗PD-(L)1治疗反应生物标志物。作者的研究发现，PD-L1 K162被SETD7甲基化，被LSD2去甲基化。此外，PD-L1 K162甲基化控制了PD-1/PD-L1的相互作用，并明显增强了对T细胞活性的抑制，控制了癌症免疫监测。作者证明了PD-L1高甲基化是抗PD-L1治疗耐药性的关键机制，研究了PD-L1 K162甲基化是非小细胞肺癌患者抗PD-1治疗的阴性预测标志物，并表明PD-L1 K162甲基化：PD-L1比值是预测抗PD-(L)1治疗敏感性的更准确的生物标志物。这些发现为PD-1/PD-L1通路的调控提供了见解，确定了这一关键免疫检查点的修饰，并强调了对PD-1/PD-L1阻断治疗反应的预测性生物标志物。
8//脑类器官移植修复中风后梗死皮质并恢复受损的功能
Cerebral organoids transplantation repairs infarcted cortex and restores impaired function after stroke
发表期刊：npj Regenerative Medicine
IF: 14.404
发表单位：南京医科大学药学院
吉凯助力：hChR2（E123A） 过表达腺相关病毒
文章摘要：由于梗死组织的永久丧失，中风通常会导致长期或终身的残疾。虽然已经探索了多种干细胞移植，通过增强神经可塑性来改善神经元缺陷行为，但梗死组织是否可以重建仍不清楚。作者在这里培养了来自人多能干细胞（hPSCs）的人大脑类器官，并将其移植到中风后NOD-SCID小鼠的梗死核心和梗死周围区的交界处。几个月后，作者发现移植的类器官在梗死核心存活良好，分化成目标神经元，修复梗死组织，发送轴突到遥远的大脑目标，并集成到主机神经回路，从而消除感觉运动中风小鼠的缺陷行为，而移植分离单细胞从类器官未能修复梗死组织。这些研究为通过类器官移植重建梗死组织提供了一种新的策略，从而逆转中风引起的残疾。
9//FAR591通过调节Fos的表达介导骨微血管内皮细胞的凋亡促进SONFH的发病机制和进展
FAR591 promotes the pathogenesis and progression of SONFH by regulating Fos expression to mediate the apoptosis of bone microvascular endothelial cells
发表期刊：Bone Research
IF: 13.362
发表单位：贵州医科大学附属医院
吉凯助力：FAR591/Fos 过表达慢病毒
文章摘要：类固醇致股骨头坏死（SONFH）的具体发病机制尚不完全清楚，目前尚无有效的早期治疗方法。了解长链非编码rna（lncRNAs）在SONFH发病机制中的作用和机制，将有助于揭示SONFH的发病机制，为其早期预防和治疗提供新的靶点。在本研究中，作者首次证实了糖皮质激素（GC）诱导的骨微血管内皮细胞（BMECs）凋亡是SONFH发病和进展的前一个事件。然后，作者通过lncRNA/mRNA芯片在BMECs中鉴定了一个新的lncRNA，命名为fos相关的lincRNA ENSRNOT00000088059.1（FAR591）。FAR591在GC诱导的BMEC细胞凋亡和股骨头坏死过程中高表达。敲除FAR591可有效阻断GCs诱导的BMECs凋亡，从而减轻GCs对股骨头微循环的损伤，抑制SONFH的发病和进展。而过表达FAR591可显著促进GCs诱导的BMECs细胞凋亡，进而加重GCs对股骨头微循环的损伤，促进SONFH的发病和进展。在机制上，GCs激活糖皮质激素受体，该受体易位到细胞核，并直接作用于FAR591基因启动子，诱导FAR591基因过表达。随后，FAR591与Fos基因启动子（-245∼-51）结合，形成稳定的RNA：DNA三联体结构，然后招募TATA-box结合蛋白相关因子15和RNA聚合酶II，通过转录激活促进Fos的表达。Fos通过调节Bcl-2相互作用中介细胞死亡（Bim）和P53上调凋亡调节剂（Puma）的表达，激活线粒体凋亡通路，介导GC诱导的BMECs凋亡，导致股骨头微循环功能障碍和股骨头坏死。综上所述，这些结果证实了lncrna与SONFH发病机制之间的机制联系，有助于揭示SONFH的发病机制，为SONFH的早期预防和治疗提供了新的靶点。
10//整合蛋白基因组学特征显示不完全射频消融后肝细胞癌微环境不平衡
Integrated proteogenomic characterization reveals an imbalanced hepatocellular carcinoma microenvironment after incomplete radiofrequency ablation
发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research
IF: 13.362
发表单位：重庆医科大学第一附属医院
吉凯助力：PRTN3 过表达/干扰慢病毒
文章摘要：精确评估肿瘤特异性T细胞免疫反应的努力仍然面临着重大挑战，而不完全射频消融（iRFA）后介导肝细胞癌（HCC）微环境失衡的潜在分子机制尚不清楚。本研究旨在进一步了解整合的转录组学和蛋白质基因组学景观，并确定一个参与iRFA后HCC进展的新靶点。收集了10例经RFA治疗的HCC患者的外周血和匹配的组织样本。采用多重免疫染色和流式细胞术评估局部和全身免疫反应。通过转录组学和蛋白质基因组学分析，探索了差异表达基因（DEGs）和差异表达蛋白（DEPs）。在这些分析中，作者鉴定出了蛋白酶-3（PRTN3）。然后，对70例RFA后早期复发的HCC患者，评估PRTN3预测总生存期（OS）的能力。通过体外CCK-8、伤口愈合和经孔实验，观察枯否细胞（KCs）与PRTN3诱导的HCC细胞之间的相互作用。采用免疫印迹法检测多种致癌因子和信号通路成分的蛋白水平。多重免疫染色显示，在iRFA作用30分钟后，肿瘤组织的局部免疫细胞计数没有立即发生显著变化。流式细胞仪显示CD4+后第5天CD4+CD8+和CD4+CD127−treg水平显著升高，CD16+CD56+自然杀伤细胞水平显著降低（p<0.05）。转录组学和蛋白质组学显示了389个DEGs和20个DEPs。通路分析显示，DEP-DEGs主要在免疫炎症反应、肿瘤进展和代谢过程中富集。在dep-deg中，PRTN3持续上调，并与射频消融后早期复发性HCC患者的OS密切相关。在KCs中表达的PRTN3可能影响热应激处理的HCC细胞的迁移和侵袭。PRTN3通过多种致癌因子和PI3K/AKT和P38/ERK信号通路促进肿瘤生长。