过多的脂肪堆积是肉鸡生产过程中不可忽视的一个问题。腹脂重(AbFW)和腹脂率(AbFP)是脂肪性状的主要表型指标。中国农科院北京畜牧兽医研究所文杰研究员的团队对影响鸡腹部脂肪堆积的关键基因进行了系统鉴定,相关成果发表在近期的Scientific Reports上。
课题组采用Beijing-You和Cobb Vantress杂交的F2代雌鸡为模型。选择极端的AbFP 和AbFW表型构建高的和低的腹部脂肪文库(分别为HAbF和LAbF),并使用转录组测序和microRNA(miRNA)测序分析它们的表达谱。相比于LAbF,在HAbF组鉴定出62个差异表达的miRNAs(DEMs)和303个差异表达的基因(DEGs)。联合分析DEMs和DEGs显示,共有106个DEGs被鉴定为62个DEMs调控的靶基因。这些基因被定义为交叉基因,其中11个基因参与脂质代谢通路。miRNA gga-miR-19b-3p通过下调ACSL1,加速前脂肪细胞的增殖,以及脂肪细胞分化。
这些研究结果表明,某些与腹部脂肪沉积密切相关的重要候选miRNAs和基因,可由联合分析DEMs和DEGs进行鉴定。这些发现增加了目前对鸡腹部脂肪堆积潜在分子遗传控制的理解。
本研究中涉及的转录组测序和小RNA测序分析均由联川生物协助完成
参考文献
Huang HY, et al. (2015) Integrated analysis of microRNA and mRNA expression profiles in abdominal adipose tissues in chickens. Sci Rep. 5:16132.
快来围观,你离高分paper还差一个phasiRNA
(2019-01-14T13:34 浏览数:4617)
如何选择合适的qRT-PCR内参基因?
(2019-01-14T11:06 浏览数:18408)
为什么要做绝对定量测序-数据分析
(2018-09-21T17:59 浏览数:4414)
低通量单碱基m6A验证的新方法|m6A专题
(2018-09-18T16:04 浏览数:4409)
祝贺联川客户继Nature后又发一篇Nature Genetics
(2018-09-18T16:03 浏览数:4219)
联川生物八月份客户文章汇总
(2018-09-18T16:02 浏览数:3089)
联川生物七月份客户文章汇总
(2018-09-18T16:01 浏览数:3079)
肝硬化与肝纤维化研究进展
(2018-09-18T16:01 浏览数:10889)
【用户案例】感染鲫鲤疱疹病毒2的银鲫中miRNA的差异表达
(2018-09-18T16:00 浏览数:3112)
病毒m6A专题 | HIV感染宿主促进病毒及T细胞m6A修饰
(2018-09-18T16:00 浏览数:3674)