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NCBI数据上传,你造吗?

作者:联川生物技术公司 2016-05-16T14:31 (访问量:17407)



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当您完成高通量测序项目,得到了期待已久的完美数据,文章也已在编辑的审核当中,这怎么看都是“走上人生巅峰的节奏“,不是么?但是一般没有到最后一步,绝对不能放松。收到编辑要求提供序列号的邮件时,您有没有无从下手的感觉呢?不用担心,今天小编就带您搞定这个坎,一点都不难哦!

今天小编会以16S测序数据上传NCBI为例,给大家专题讲解,欲知其他数据如何上传,且听下回分解~~

一、注册信息

进入NCBI官网主页:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/,点击右上角的Signin to NCBI,填写注册信息。

二、数据上传

1. 登录后,在NCBI主页面上点击Submit,选择“GeneBank”和“16S rRNA from bacteria/archaea”;

2. 完成后,跳转页面,点击“New Submission”。数据上传一共分为6步。接下来由小编带您完成这最关键的步骤。

3. 正式上传

第一步:输入您的信息,提醒您尽量完整及准确;

第二步:测序相关信息填写:勾选相应的测序平台和组装序列;填写相应软件及其版本

第三步:根据您的实际情况选择相应释放信息的时间等,点击浏览,导入您的“OTU_rep_seqs.fasta”文件。

温馨提示:该文件在summary\03_OTU_profiling\02_OTU_rep_seqs

第四步:下载source_modifiers.tsv,填写相应的内容,另存为“.txt”格式,进行上传;


第五步:需要老师填写相应的作者和即将发表的文章名称,点击“continue”;

温馨提示:这部分老师可以等文章题目等确定后再写;当然要是您已经填好,但是后续又修改了,后续也是可以登录您的账号在此进行修改的,莫慌莫慌!

第六步:当您前五项信息都已完全确认后(务必完全确认,提交后再修改会比较繁琐),确认页面中的所有信息,点击Submit完成所有操作。

4. 提交后,网站官方会邮件提醒您正在进行审核中,通过后您就能获得心水已久的序列号啦!

通过以上操作,我们就能解决16S测序数据上传问题,是不是很简单,学会后记得广而告之哦~~

如果您想了解更多测序数据上传(数据上传GEO),欢迎报名联川生信培训营哦~~

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