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更新时间: 2024-12-20T09:45:01

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DNA 测序原理

DNA 测序技术主要依据 Sanger 的双脱氧链终止法。以 DNA 单链为模板,在特定条件下,用特异的引物在测序级 DNA 聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则,不断将 4 种脱氧核糖核苷酸 (dNTP) 加到引物的 3- 羟基末端并使引物链得到延伸。这种链的延伸是通过引物的 3- 羟基和脱氧核糖核苷酸底物的 5- 磷酸基团形成磷酸二酯键来完成的。如果这种反应体系中加入双脱氧核糖核苷酸 (ddNTP) ,这种 23ddNTP 的 5- 磷酸基团是正常的 (4 种不同的荧光标记 ) ,而 3 位置缺少羟基,因此在 DNA 聚合酶作用下,仍然可以通过 5- 磷酸基团与引物链的 3- 羟基反应掺入到引物链中,但是由于 ddNTP 没有 3- 羟基,不能继续与下一个 5- 磷酸基团形成磷酸二酯键而导致引物链延伸的终止。这样,在测序反应体系中, DNA 引物链不断合成与偶然终止,产生一系列的长短不等的核苷酸链,然后将这些反应产物进行电泳,即可得测序图谱。

样品要求

样品类型

相应要求

菌体

1. 说明载体抗性类型,我们提供 Amp, Kan, Tet 及 Chl 四种抗生素。
2. 提供 1ml 左右过夜培养的菌液,加 15 灭菌甘油,于 Eppendorf 管中封口保存,防止交叉污染或渗漏。
3. 大量样品测序,建议在一次性塑料培养皿固体培养基上穿刺培养。
4. 建议尽量提供穿刺培养的菌种。

质粒

1. 质粒溶于适量体积双蒸水中(不含 TE ),电泳检测总量大于 2mg 。

2. 建议用相关试剂盒纯化。
3. 如有可能,同时提供 1ml 含有相应质粒的菌液备用。
4. 大质粒必需注明载体长度。

未纯化 PCR 产物

1. 片段大于 150bp 。
2. 提供 50ul ~ 100ul PCR 扩增产物 ( 总量 500ng-1ug) 。
3. 取 3ul 样品,电泳检测应为明亮的一条带,无杂带。

纯化 PCR 产物

1.PCR 产物溶于双蒸水中(不含 TE )。

2. 浓度大于 20ng/ul ,体积大于 20ul ,长片段需适当增加量。
3. 电泳检测条带专一。

自备的引物

1. 浓度不低于 5pmole/ul( 或 5umol/L) ,体积大于 20ul 。
2. 随机引物和简并引物不能用于测序。
3. 尽可能提供引物全序列、 PCR 退火温度,以供参考。